Географическое распространение и филогения вирусов Sewees (SWSV) и Altai (ALTV), циркулирующих в землеройках на территории России
В совместном исследовании ученых из ГНЦ ВБ «Вектор», ИСиЭЖ СО РАН, Томского государственного университета и нескольких университетов Японии и США изучено географическое распространение и филогения вируса SWSV и вируса ALTV на территории азиатской части России. Хантавирусы (семейство Bunyaviridae), принадлежащие к числу наиболее важных зоонозных патогенов человека, на основании анализа нуклеотидных и аминокислотных последовательностей разделены на четыре рода – Orthohantavirus, Thottimvirus, Loanvirus и Mobatvirus. Вирус SWSV (род Orthohantavirus) широко распространен по всему географическому ареалу своих носителей, включая обыкновенную (Sorex araneus), тундряную (S.tundrensis) и крупнозубую (S.daphaenodon) бурозубок. У средней бурозубки (S.caecutiens) были обнаружены отличающиеся генетические варианты SWSV, ранее названные вирусом Artybash (ARTV) и вирусом Amga. У обыкновенной бурозубки, пойманной в 2007 году вблизи Телецкого озера (Республика Алтай) идентифицирован новый вирус Altai (ALTV), обнаруженный также на территории Томской области. Полный анализ геномной последовательности показал, что ALTV является новым видом хантавирусов наиболее близким к мобатвирусам, ассоциированным в основном с летучими мышами. Другой вирус – Lena (LENV), близкий к ALTV, циркулирует в средней (S.caecutiens) и плоскочерепной (S.roboratus) бурозубках на территории Восточной Сибири и Дальнего Востока. В результате исследования показано, что два значительно различающихся вируса, ALTV и SWSV, одновременно циркулируют среди обыкновенных бурозубок в Западной Сибири, тогда как вирусы LENV и вариант ARTV вируса SWSV также одновременно циркулируют среди средних бурозубок в Восточной Сибири и на Дальнем Востоке России. ALTV и LENV принадлежат к роду Mobatvirus, тогда как SWSV включен в род Orthohantavirus. Эти факты свидетельствуют о том, что ALTV-подобные хантавирусы возникли в ходе эволюции в результате межвидового перехода с последующей диверсификацией среди бурозубок рода Sorex на территории Евразии.
Статья опубликована в журнале Viruses (Q2).