Включают изучение пространственной структуры и организации животного населения, разработку принципов и методов его мониторинга и их реализацию при слежении, оценке и прогнозировании распределения и численности эталонных групп животных (земноводных, пресмыкающихся, птиц и мелких млекопитающих). Прикладные аспекты этих работ сводятся к слежению за состоянием численности охотничье-промысловых птиц, редких и исчезающих животных Западно-Сибирской равнины и Алтае-Саянской горной страны, к изучению географии природных очагов клещевого энцефалита, болезни Лайма и др. сочeтанных с ними инфекций.

        При лаборатории с 1981 г. функционирует банк данных коллективного пользования.