Единственное подразделение, которое входит в состав института с момента его образования, – это лаборатория Сибирский зоологический музей. К 1944 году в здании института еще не выветрился дух госпиталя, размещавшегося здесь в годы войны; еще снились разрывы снарядов научным сотрудникам, вернувшимся с полей сражений, еще болели раны, полученные в боях, однако институт уже активно функционировал. Всего через год после начала работы один из основателей института, известный в Сибири ученый, профессор Янушевич создал при своей лаборатории фауны позвоночных животных небольшую зоологическую выставку. Она представляла собой 2 десятка чучел сибирских зверей и птиц, это было первое зернышко, брошенное на музейную ниву. С 1945 по 1960 год в лабораториях Биологического института скопились огромные зоологические материалы. Их надо было хранить, инвентаризировать, классифицировать. Маломощным лабораториям, выполнявшим другие задачи, это было не под силу. Тогда дирекция и Ученый Совет института в конце 1960 года приняли решение об организации специального структурного подразделения – Зоологического музея в ранге самостоятельной лаборатории.
Одной из первых перекочевала в музей обширная коллекция жуков-щелкунов профессора Черепанова, возглавлявшего в те годы Биологический институт. В основу коллекции млекопитающих легло личное собрание известного зоолога, профессора Строганова. Из Барнаула была передана в Новосибирск коллекция жесткокрылых, собранная известным сибирским натуралистом Евгением Георгиевичем Роддом. Из Минусинского краеведческого музея были доставлены в Новосибирск последние остатки коллекции насекомых знаменитых в свое время энтомологов – отца и сына Кожанчиковых. Первые штатные сотрудники музея с нуля начали постановку коллекций саранчовых, жуков-жужелиц, чернотелок и листоедов и других насекомых. Были заказаны и изготовлены первые специальные коллекционные емкости, разработана система этикетажа и создан большой запас этикеток разного формата и назначения. Были этикетированы по новому музейному стандарту первые тысячи экспонатов. К 1964 году коллекция обрела зримые черты.
С 1965 по 1981 год большая часть материалов была этикетирована, инвентаризирована, организована и размещена в новых коллекционных емкостях. Общее число единиц хранения возросло до 0,5 млн. Новые поступления потоком шли из других лабораторий института. В это время в музее были созданы коллекции по многим группам насекомых – стрекозам, клопам, тлям, жукам-дровосекам, божьим коровкам, комарам, мошкам, оводам, мухам и другим.
Активно собирали материал штатные сотрудники музея, которые совершили ряд экспедиций и тематических поездок для сбора коллекционных материалов в лесотундру Западной Сибири, Западный Саян, Забайкалье, Приморье, на Курильские острова, Чукотку, Кавказ, в Казахстан, Туркмению, Таджикистан. Только млекопитающих было собрано более 5000 экземпляров, из них 3500 вошло в фонд музея в виде тушек. Была закуплена уникальная коллекция гнезд и кладок 560 видов птиц, принадлежавшая известному русскому орнитологу и писателю-натуралисту Евгению Павловичу Спангенбергу. Из Барнаула была передана обширнейшая коллекция чешуекрылых Родда, собранная на юге Западной Сибири в конце XIX – начале XX веков. Музей пополнился и крупными частными собраниями.
В марте 1981 года произошла крупная реорганизация института, зоомузей возглавил известный сибирский энтомолог профессор Черепанов. При нем коллекция продолжала расти, а при музее возник небольшой кабинет систематики и филогении насекомых, где работали крупные специалисты. С 1983 года музеем стал заведовать профессор Георгий Сергеевич Золотаренко, известный сибирский энтомолог. Его основной заботой стало интенсивное пополнение коллекции, особенно беспозвоночных животных (чешуекрылых, двукрылых и других). По его инициативе началось создание коллекции препаратов на стеклах, формирование спиртовой коллекции млекопитающих, каталогизация музейных фондов. Штат музея вырос до 12 сотрудников.
В конце 1980-х назрела насущная необходимость системного развития музея. Бурный рост объема и усложнение инфраструктуры коллекции требовали не только освоения новых емкостей хранения, но, прежде всего, резкого усиления научного потенциала музея. Известность коллекции вызывала интерес к ней со стороны не только ученых, но также просветительских и образовательных организаций. Их интересовали не фонды, а экспозиция. Реализация системного плана развития привела к желаемым результатам. Инфраструктура музея год от года становится все сложнее и богаче, благодаря увеличению числа представленных семейств животных до 600. Особенно резкий прирост в последние годы характерен для паукообразных, клещей, жесткокрылых, полужесткокрылых, прямокрылообразных и сетчатокрылых насекомых. Активно формируется коллекция типовых экземпляров, в том числе голотипов. Ранее голотипы передавались в музеи европейской России. Сегодня они остаются в Сибирском зоологическом музее. Их число достигло уже многих сотен.
Улучшен дизайн коллекции. Созданы музейные каталоги многих групп животных в типографском и компьютерном вариантах, на русском и английском языках. Увеличилась площадь музея, которая составляет 400 м2, из них коллекциями занято 270 м2. Рост коллекции идет не только за счет сборов сотрудников музея и других лабораторий Института систематики и экологии животных, но и путем обмена с другими музеями мира.
Сегодня новосибирцы и гости города могут стать гостями крупнейшего профессионального зоологического музея. Посещение осуществляется по предварительной договоренности, как принято во всех музеях при институтах. Коллекция музея – одна из лучших в стране – содержит более 13 млн единиц хранения по 600 семействам и 25 тысячам видам животных. Коллекция полностью инвентаризирована, достоверно определена до вида, структурирована, зарегистрирована в каталогах и базах данных в соответствии с современной классификацией животных. В 30 тематических витринах экспозиции представлены 1,5 тысячи натурных образцов 1200 видов животных.
Сочетание теоретических и экспериментальных исследований с богатой экспедиционной практикой позволяет институту на должном уровне решать многие фундаментальные задачи современной биологии. Спектр вопросов, стоящих перед институтом, огромен, но основное направление его деятельности, безусловно, связано с сохранением и рациональным использованием богатого животного мира Сибири. И сотрудники Института систематики и экологии животных Сибирского отделения Российской академии наук готовы делать все для решения этой чрезвычайно сложной и актуальной проблемы – сохранить для потомков прекрасное наследие уникальной сибирской природы!